Dostępne opcje:
| SKU | Ćwiczenia | ||
|---|---|---|---|
 | DY62. | 1 ćwiczenie | Zapytaj o ofertę |
| DY625 | 5 ćwiczeń | Zapytaj o ofertę |
Zawartość zestawu EasyGenotyping ITS PCR (1 ćwiczenie DY62)
6 kompletów odczynników do reakcji PCR:
– 6 probówek zawierających 10x bufor do reakcji PCR (każda na 10 reakcji)
– 6 probówek z roztworem MgCl2 (każda na 10 reakcji)
– 6 probówek z gotową do użycia mieszaniną dNTPs 8 mM (każda na 10 reakcji)
– 6 probówek ze starterem L1 (każda na 10 reakcji)
– 6 probówek ze starterem G1 (każda na 10 reakcji)
– 6 probówek z wodą do PCR
– 6 probówek z termostabilną polimerazą (każda na 10 reakcji)
– 18 probówek zawierających wyizolowane genomowe DNA 6 różnych gatunków bakterii (po 3 izolaty/gatunek), przeznaczonych do różnicowania metodą rybotypowania (każda na 3 reakcje)
Ponadto:
– rotokoły laboratoryjne (7 szt., w tym jeden z dodatkowymi informacjami dla prowadzącego)
– rękawiczki nitrylowe (6 par o rozmiarach S, M, L)
– agaroza (5 g)
– bufor do elektroforezy – 50x TAE (50 ml)
– bromek etydyny – 1 mg/ml (100 µl)
– wzorzec masy cząsteczkowej DNA – M100-1000 ready-to-use (10 ścieżek elektroforetycznych)
– bufor do nanoszenia DNA na żel – 6x GREEN (0,5 ml)
CEL: Zestaw ma na celu zapoznać studentów z metodami Rybotypowania. Różnicowanie mikroorganizmów opiera się często na genach kodujących rybosomalny RNA (rRNA) małej i dużej podjednostki rybosomu. Geny te, ułożone w operon rrn są charakterystyczne dla wszystkich organizmów bakteryjnych. Między sekwencjami odpowiedzialnymi za syntezę podjednostek rybosomalnych 16S, 23S i 5S rRNA występują regiony polimorficzne o zróżnicowanej wielkości i sekwencji. Stanowią one doskonały cel molekularny wykorzystywany w badaniach filogenetycznych. Celem ćwiczenia jest wykorzystanie rybotypowania do różnicowania międzygatunkowego i wewnątrzgatunkowego dostarczonych szczepów bakteryjnych (DNA 6 różnych gatunków, po 4 izolaty dla każdego gatunku).
Zestaw pozwala na przeprowadzenie ćwiczenia podczas dwóch zajęć laboratoryjnych (I – przygotowanie r-cji PCR – 1,5-2 h, II – elektroforeza – 2 h). Sugerujemy przeprowadzenie ćwiczenia laboratoryjnego w sześciu dwuosobowych grupach studenckich.